Även om det var ganska länge sedan man hade ett lag i Allsvenskan så står ändå fotbollen i Jönköping på stadiga ben.I dagsläget är Jönköpings Södra IF det främsta fotbollslaget i stan. Klubben i december 1922 och spelar sina hemmamatcher på Stadsparksvallen som har plats för 5 500 åskådare.Under 1940-, 1950-, samt 1960-talet gjorde klubben sammanlagt tio säsonger i Allsvenskan. Säsongen 1949/50 lyckades man till och med knipa en andraplats. Senaste allsvenska säsongen gjorde man 1969. Därefter spenderades de följande årtiondena i de lägre divisionerna.Efter seger i division 2 och efterföljande kvalspel lyckades man hösten 2005 ta sig upp i Superettan. De senaste säsongerna har Södra gjort riktigt bra ifrån sig och till och med nosat på kval till Allsvenskan. I år slutade man på en fjärdeplats.Förutom Jönköpings Södra har Jönköping ytterligare ett lag i Superettan, eller åtminstone hade, i form av Husqvarna FF, vilka tyvärr slutade på sista plats och således får spela i division 1 nästa år.Husqvarna FF bildades år 1987 efter en sammanslagning mellan Husqvarna IF och Huskvarna södra IS och var under slutet av 1990-talet bättre än Jönköpings södra då man spelade en säsong i dåvarande division 1.Hemmamatcherna spelar man på Vapenvallen med plats för 5 000 åskådare.